У вариантов вируса кори, выделенных от пациентов, страдающих КЭВ, М- белок не продуцировался вовсе, а мРНК, кодирующая данный белок, имела много мутаций. Анализ М-гена и 4-х других генов в этом случае обнаружил наличие феномена гипермутации, который мог быть ответственным за выключение функции М-белка. Однако способность генома вируса к репликации при этом сохранялась. Этот факт свидетельствовал о селективном преимуществе распространения мутантного генома в мозге, поскольку только мутантные геномы были обнаружены в мозге пациента, страдающего КЭВ.

Таким образом , очень возможно, что развитие летальной инфекции в человеческом мозге связано с возникновением единичного мутантного клона вируса кори.